Ένα από τα γεγονότα που επηρέασαν την ιστορική διαδρομή του τόπου μας και που αποτυπώνεται στα εκθέματα του μουσείου είναι και η Ναυμαχία της Ναυπάκτου. Η Ναυμαχία εντάσσεται στις γενικότερες πολεμικές αψιμαχίες μεταξύ Οθωμανών και Βενετών στην ευρύτερη Μεσόγειο, αλλά έχει ειδικό ενδιαφέρον, διότι σ’ αυτήν συμμετείχαν πολλοί Έλληνες, ελπίζοντας πως πιθανή νίκη θα οδηγούσε σε νέα Σταυροφορία και απελευθέρωση της Ελλάδας από τους Οθωμανούς.